Le conseil d'administration est responsable de la direction et de la gestion du CQMF. Il agit comme représentant officiel des médecins de famille et de leurs patients, auprès des différents paliers de gouvernements, des médias, du public, des médecins et autres fournisseurs de services de santé.

Il est du ressort exclusif du conseil d'administration en tant qu'autorité suprême du Collège québécois d'avoir les responsabilités suivantes:

Gérer ou superviser la gestion des affaires du Collège québécois et exercer tous les pouvoirs du Collège québécois.

• Déléguer comme il juge bons ses pouvoirs et ses obligations à un comité, un membre ou le secrétaire administratif pour un but spécifique.
• Créer ou abolir tout comité permanent ou comité ad hoc, établir les mandats, vérifier le nombre de membres et la composition afin de leur déléguer les obligations adéquates selon leur statut.
• Créer des règlements visant la bonne gestion du Collège québécois en autant que ces règlements ne contreviennent pas à la présente constitution ou à la constitution du Collège.
• Assurer la bonne gestion financière du Collège québécois.
• Investir l'argent du Collège québécois seulement dans des valeurs sûres.
• Emprunter de l'argent dans des conditions qu'il jugera bonnes et non au-delà des revenus anticipés.
   

Le conseil d'administration est responsable vis-à-vis des membres et fera un rapport aux membres lors de l'assemblée générale annuelle. Le conseil d'administration révisera annuellement la performance et la pertinence des comités.

Le conseil d'administration pour l'année 2012 est composé des membres suivants:

Dr Antoine Groulx Président du comité de direction	Dre Dominique Deschênes Présidente désignée
Dre Annick Turcotte Secrétaire-trésorière	Dre Caroline Laberge Vice-présidente aux communications
Dre Leonora Lalla Vice-présidente au développement professionnel continu	Mme Nicole Cloutier Directrice générale
Dre Eveline Hudon Représentante des membres	Dre Line Langlois Représentante des membres
Dre Justine Galarneau-Girard Représentante des résidents	Dre Jessica Lee Représentante des résidents
Mme Marie-Claude Moore Représentante des étudiants, GIMF Université de Montréal	Mme Marie-Maude Morin Représentante des étudiants, GIMF Université de Sherbrooke
Dre Johanne Théorêt Représentante régionale (Est-du-Québec)	Dr Réjean Duplain Représentant régional ( Sud-du-Québec)
Vacant Représentant régional ( Nord-Ouest-du-Québec)	Dre Maxine Dumas-Pilon Représentante régionale (Métropole)
Dre Marie Giroux Représentante des départements de médecine familiale	Dre Marie-Pierre Dumas Représentante de la section enseignement
Dr Hanna Nicolas Représentant de la section intérêts particuliers ou pratiques ciblées	Dr Philippe Karazivan Représentant de la section recherche
Dr Jean Zigby Représentant du comité santé et environnement

Le personnel administratif est composé de:

Mme Caroline Labrie Coordonnatrice au développement professionnel continu

Mme Pascale Rolland Agente aux communications et à la direction